Kristi Noem sinh ra ở thành phố Watertown, quận Codington, South Dakota, Hoa Kỳ, tên khai sinh là Kristi Lynn Arnold, là con gái của Ron D. Arnolds và Corinne Arnold, lớn lên cùng các anh chị em trong trang trại của gia đình ở vùng nông thôn quận Hamlin, South Dakota. Gia đình có tổ tiên là người Na Uy. Bà tốt nghiệp Trường Trung học Hamlin vào năm 1990, và giành được danh hiệu hoa khôi Nữ hoàng tuyết South Dakota (South Dakota Snow Queen),[2] đây được xem như là một kỷ niệm, kinh nghiệm đã giúp bà trau dồi kỹ năng nói trước đám đông từ thời thanh niên. Sau khi tốt nghiệp trung học, bà đăng ký học tại Đại học Northern State ở thành phố Aberdeen, quận Brown, South Dakota. Năm 1993, ở tuổi 22, bà rời trường đại học để giúp điều hành trang trại của gia đình sau khi bố cô qua đời trong một vụ tai nạn máy móc nông trại. Bà đã dựng thêm một nhà nghỉ săn bắn và nhà hàng ở trang trại, cùng tất cả các anh chị em đã chuyển về để giúp mở rộng hoạt động kinh doanh. Sau cái chết của bố, bà ngừng theo học đại học toàn thời gian nhưng sau đó tham gia các lớp học tại khuôn viên Watertown của Cao đẳng Mount Marty và tại Đại học Bang South Dakota và các lớp học trực tuyến của Đại học South Dakota.

Sau khi được bầu vào Quốc hội, Kristi Noem tiếp tục con đường học vấn của mình, tham gia các khóa học trực tuyến. Washington Post mệnh danh bà là thực tập sinh quyền lực nhất của Capitol Hill vì đã nhận được chứng chỉ thực tập đại học khi đang giữ vị trí Hạ nghị sĩ Hoa Kỳ.[3] Bà lấy bằng Cử nhân Nghệ thuật chuyên ngành Khoa học chính trị tại Đại học Bang South Dakota vào năm 2012.[4]